澳大利亚东北部棉区海拔高度较低，一般只有几米至几十米，离海洋都很近。从北向南分别属热带干湿季气候区和热带海洋性气候区。该棉区热量资源十分丰富，终年气温较高。气温最低的7月日平均温度一般为14~24℃，最热月1月的日平均气温大多在26~29℃。气温年较差很小，没有明显的季节变化，棉花全年都可生长。这里降水是全澳大利亚最丰沛的地区，年平均降水量一般都在1000mm以上，局部迎风坡地区甚至达4000mm以上，与内陆广大的干旱与半干旱荒漠区形成了鲜明的对照。由于该区域冬季受来自大陆离岸信风的影响，气候相对比较干燥，降水较少，夏季受来自海洋气流的影响，降水充沛。以汤斯维尔 (Townsville，19º14ˊS，146º51ˊE)为例，其年平均降水量为1215mm，其中夏季12月至翌年3月占80%，而5~9月仅占10%。棉区的日照也对棉花比较有利，每天的平均日照时数一般可达 6h以上。

澳大利亚东南部棉区地处内陆，主要分布于墨累河流域平原区。这里属热带干旱、半干旱气候区，热量条件仍然较好，年平均无霜期250~300天，最冷月7月的平均气温大多在10℃以上，最热月1月平均气温高于25℃，全年有5个月的平均气温在20℃以上。夏季一般都很炎热，10月至翌年3月最高气温都可超过40℃，有些地方经常可达45℃，极端最高气温超过50℃。气温的年较差和日较差都较大，各月的气温日较差平均都在12℃以上。10月至翌年2月更高达15~17℃，与中国新疆棉区很相似。由于东部近似与海岸平行的山脉阻隔了来自海洋的气流，这里很难受到海洋湿润气候的影响，因而降水较稀少，一般只有250~500mm，且降水量的季节分配均匀，没有明显的干湿季之分，全年气候均相当干燥，棉田主要依赖灌溉。该棉区的日照十分丰富，大多数地区年平均日照时数达3000h左右，也与中国东疆亚区相近。因此，这里的宜棉程度主要取决于灌溉条件。如果灌溉水源充足，这里的棉花可获得较高的产量和优良的品质。